Bz-rC fosforamidiitti

Bz-rC Fosforamidiitti on perusmonomeeri RNA-oligonukleotidien kemiallisessa synteesissä. Sytosiiniemäksessä oleva N4-bentsoyylisuojaryhmä estää haarautumisen ja ketjun päättymisen fosforamidiittikytkentäsyklin aikana, kun taas 2'-O-TBDMS-ryhmä suojaa 2'-hydroksyyliä koko ketjun kokoonpanon ajan ja poistetaan synteesin jälkeen käyttämällä fluoripohjaisia ​​reagensseja, kuten trietyyliamiinitrihydrofluoridi (TEA·3HF). Bz-rC-fosforamidiitti on yhteensopiva automatisoitujen DNA/RNA-syntetisaattoreiden (esim. Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo) standardien RNA-synteesiprotokollien kanssa, joissa käytetään tyypillisesti 0,25 M aktivaattoriliuoksia (5-etyylitio-1H-tetratsoli, 4,5-disyaani-imidatsolia 0 minuuttia). Bz-rC-fosforamidiitti on validoitu laajasti RNA:n synteesissä rakennetutkimuksia, antisense-oligonukleotideja, siRNA:ta ja aptameeriä varten. Bz-rC-fosforamidiittia käytetään myös vertailustandardina oligonukleotidien epäpuhtauksien profiloinnissa, koska bentsoyyliryhmä voi aiheuttaa tyypillisiä sivutuotteita (esim. N4-bentsoyyli-depyrimidinaatiotuotteita), joita on seurattava prosessin kehittämisen aikana.

Tuoteparametrit

Laadunvarmistus Cosperpharmilla

Jokainen erä käy läpi:

● Kaasukromatografia (GC) – puhtaus ≥97,0 %

● Ei-vesipitoinen titraus – puhtaus ≥97,0 %

● Taitekerroin – vahvistava analyysi

● ¹H NMR – rakenteellinen varmistus

● Ulkonäkö – väritön tai vaaleankeltainen tai vaalean oranssi kirkas neste

Jokaisen lähetyksen mukana tulee kattava aitoustodistus, käyttöturvallisuustiedote (jolla on täydelliset GHS-tiedot) ja alkuperätodistus.

FAQ

K1: Mitä eroa on Bz-rC-fosforamidiitin ja Ac-rC-fosforamidiitin välillä?

A: Bz-rC Fosforamidiitti käyttää bentsoyyliä (Bz) suojaavaa ryhmää sytosiinin N4-eksosyklisessä amiinissa, kun taas Ac-rC käyttää asetyyliryhmää (Ac). Bentsoyyliryhmä tarjoaa paremman suojan depyrimidinaatiota vastaan ​​DMT:n poiston happamissa olosuhteissa (3 % trikloorietikkahappo dikloorimetaanissa). Useimmissa RNA-synteesisovelluksissa bentsoyyliryhmä on edullinen pitkille tai runsaasti deoksisytidiiniä sisältäville sekvensseille.

Q2: Mikä on Bz-rC-fosforamidiitin suositeltu kytkentäaika tavallisessa syntetisaattorissa?

V: Tavallisissa RNA-synteesiolosuhteissa 0,25 M aktivaattorilla (esim. 5-etyylitio-1H-tetratsoli tai 4,5-disyaani-imidatsoli) 5-10 minuutin kytkentäaika on tyypillinen Bz-rC-fosforamidiitille. Pidemmillä oligonukleotideillä (>40-meeri) tai korkean suorituskyvyn synteesillä aktivaattorikonsentraation ja kytkentäajan optimointi voi parantaa saantoja.

Tuotteen sovellusskenaariot

1. RNA-oligonukleotidisynteesi

Bz-rC Fosforamidiitti on standardi rakennuspalikka sytidiinitähteiden lisäämiseksi synteettisiin RNA-oligonukleotideihin tutkimusta, diagnostiikkaa ja terapeuttista kehitystä varten.

2.siRNA:n valmistus

Käytetään sisällyttämään 2'-OH-sytidiiniä siRNA-duplekseihin. TBDMS-ryhmä poistetaan synteesin jälkeen, jolloin saadaan täysin natiivi RNA:ta RNAi-tutkimuksia varten.

3. Antisense-oligonukleotidin (ASO) synteesi

RNA-transkripteihin kohdistuvat ASO:t vaativat RNA-segmenttejä (esim. gapmer-malleissa). Bz-rC Fosforamidiitti tarjoaa tarvittavat sytidiinitähteet täydellä nukleaasiresistenssillä, kun se jätetään 2'-OH:ksi tai modifioituna.

4.RNA Aptamer Generation

Aptameerikirjastot ja yksittäiset aptameeriehdokkaat syntetisoidaan kemiallisesti käyttämällä Bz-rC-fosforamidiittia sekvenssin tarkkuuden ja skaalautuvuuden varmistamiseksi.

5. Rakennebiologia RNA:n valmistus

Röntgenkristallografia- ja NMR-tutkimuksia varten hyvin määritellyt RNA-sekvenssit on syntetisoitava erittäin puhtaasti. Bz-rC Fosforamidiitti tarjoaa vaaditun kytkentätehokkuuden ja suojauksen poiston puhtauden.

6. Epäpuhtauksien profiloinnin vertailustandardi

Mahdollisena prosessiepäpuhtautena oligonukleotidi-lääkeaineissa (esim. jäännös-N4-bentsoyyli-sytidiini, epätäydelliset suojauksenpoistotuotteet) Bz-rC-fosforamidiitti tai sen suojauksesta poistetut johdannaiset toimivat vertailustandardeina HPLC- ja LC-MS-menetelmissä.

Ota yhteyttä

Oletko valmis tilaamaan Bz-rC-fosforamidiittia seuraavaan RNA-synteesiprojektiisi? Cosperpharm-tiimi on valmiina keskustelemaan puhtausvaatimuksistasi, dokumentaatiotarpeistasi ja toimitusaikatauluistasi.